بررسی ایمونوانفورماتیکی پروتئین تروپومیوزین کنه بوافیلوس

زمینه مطالعه: کنه بوافیلوس‌ ‌سبب انتقال برخی از اجرام پاتوژن و کاهش تولید در گاو می‌شود. پروتئین تروپومیوزین، تنظیم گر فعالیت اکتین بـوده و نقـش مهمـی در واکنش‌های ایمنی، آلرژی و تهیه واکسن دارد. هدف: روش‌های مرسوم شناسایی دقیق شاخص‌های آنتی ژنتیک (اپی توپ‌ها)،  طاقت فرسا، زمان بر و پرهزینه است، لذا توجه ما در این مطالعه به سمت توسعه روش‌های سریع تر نظیر پیشگویی اپی توپ‌های احتمالی مورد شناسایی سلول‌ B‌ و ‌+4TCD‌، مبتنی بر توالی و ساختار پروتئین می‌باشد. روش کار: از گستره وسیعی از برنامه‌ها و ابزارهای ایمونوانفورماتیک جهت آنالیز آنتی ژنسیتی، فراوانی ساختار ثانویه پروتئین و دومن‌ها، فاکتورهای فیزیکوشیمیایی مرتبط با مکان اپی توپ‌های خطی ،اپی توپ‌های سلول ‌B‌، قطعات پپتیدی متصل شونده به آلل‌های MHC کلاس 2 گاو  استفاده گردید. نتایج: آنالیز پروتئین با الگوریتم‌های مختلف و انتخاب‌ ‌اپی تـــوپ‌هـــای مـــورد تـــوافـــق در بـیـشـتــر ابــزارهــا مـنـجـر بـه بـه‌دسـت آمـدن سـه پپتیـد بـرگـزیـده  بـا خـاصیـت اپـی تـوپـی بـرای سلـول B 80-62-EQLSQANSKLEEKDKALQA-COOH) AA2(NH‌، ‌185-170-AMVEADLERAEERAETG-COOH) AA2(NH  و 218-200-VGNNLKSLEVSEEKALQKEET-COOH)AA2(NH ‌و یـــــــک پـــپـــتـــیـــــــد بــــــرای سلـــــول T 207-192-LEEELRVVGNNLKSL-COOH) AA2(NH گـردیـد. نتیجه گیری نهایی: جهت تحریک رضایت بخش سیستم ایمنی تنها قطعاتی از پـروتئیـن (اپی توپ‌ها) کافی می‌باشد. انتخاب اپی توپ‌های بهینه سبب تمرکزپاسخ ایمنی و تهیه واکسن مناسب شده و از پاسخ‌های آلرژیک و نامطلوب می‌کاهد.